FLYBIT / INDEX
GEO与ENCODE数据来源指南
理解accession、样本元数据、处理文件与实验条件,避免只凭编号判断资料质量。
GEO
GSM通常对应样本,GSE对应系列。打开记录后继续查看组织、细胞、处理、平台和补充文件。
ENCODE
实验、生物样本、文件和分析流程分别有自己的编号。保守IDR峰与单次重复结果属于不同层级。
CistromeDB
统一处理大量ChIP-seq与开放染色质资料,并提供质量指标。分数有助筛选,但不能代替样本适用性。
FLYBIT / INDEX
GSM通常对应样本,GSE对应系列。打开记录后继续查看组织、细胞、处理、平台和补充文件。
实验、生物样本、文件和分析流程分别有自己的编号。保守IDR峰与单次重复结果属于不同层级。
统一处理大量ChIP-seq与开放染色质资料,并提供质量指标。分数有助筛选,但不能代替样本适用性。